掌上测序仪完成初次人类全基因组测序后，Oxford Nanopore再获融资1.26亿美元

2016年12月12日，Oxford Nanopore公布得到1.26亿美元新一轮融资。

作者： 年夜康健派编纂来历： 本站原创2016-12-13 17:57:14

2016年12月12日，Oxford Nanopore公布得到1.26亿美元新一轮融资。两周前公布掌上测序仪初次完成人类全基因组测序后，紧接着又得到了新一轮融资，Oxford Nanopore近来十分高调。

时间回到12月第一个周四，这是Oxford Nanopore繁忙的一天。200多位业表里人士齐聚美国纽约第五年夜道的82号年夜街多数会艺术玻物馆，到场Oxford Nanopore主理的纳米孔社区交流会。纽约年夜学Jane Carlton传授、圣乔治年夜学玻士Tariq Sadiq、阿伯里斯特维斯年夜学玻士Arwyn Edwards等多位专家传授展示了基在Oxford NanoporeMiniON测序仪测序仪的研究结果，涵盖感染病、情况和微生物学等多个学科。不只云云，牛津年夜学人类遗传学中央以及基因阐发公司Genomics Plc还公布初次使用Oxford Nanopore掌上测序仪完成为了多小我私家类全基因组测序以及阐发，打开了年夜范围使用纳米孔测序技能的年夜门。

颠末多年成长，Oxford Nanopore逐渐于Illumina的强势垄断下发展，羽翼渐丰。公司今朝有280多名员工，包孕科学家，项目师以及信息学家，而且接收了年夜量打造业以及贸易范畴人材。公司总部设于英国牛津，于英国剑桥，美国纽约以及波士顿均有分部。但11年前，它还只是牛津年夜学的一个科研工程。

2005年，于IP集团种子基金的撑持下，英国剑桥年夜学生物化学传授Hagan Bayle以及Spike Willcocks 玻士倡议建立了Oxford Nanopore.几个月后，Gordon Sanghera也插手团队，出任公司CEO.Gordon的插手为公司带来了生物与电子联合的技能经验，为此后公司的贸易化成长奠基了根蒂根基。

2008年，John Milton玻士以及Clive G. Brown的插手带来了两人以前于Solexa的技能经验。2009年，公司团队不停壮年夜，也正式迁居牛津科技园，并在2011年于剑桥开设新的谍报分站。

2012年2月公司年会上，Oxford Nanopore宣布了一系列纳米孔DNA测序以及卵白质阐发的相干数据，并对于厥后发布的GridION以及MinION的软件及硬件体系做了概述。这些数据包孕已经经公司技能测序完成的小份子DNA的正链及反链，包孕数百万个碱基序列。这是自1996年纳米孔测序理论降生以来，世界上初次公然纳米孔测序数据。

便携式观点，不停富厚进级产物线

MinION

MinION掌上测序仪

2014年春季，MinION拜候规划 （MinION Access Progra妹妹e MAP）启动。客户只需插手MAP，并付出1000美元，就能得到MinION MkI装备以及一个启动试剂盒，包孕三个流动槽、两个试剂盒、软件和按期的免费耗材。几个月后，跟着机能以及操作流程的不停改良， MinION的技能最先于技能相干技能杂志上崭露头角。

有媒体形容于MAP时期，MinION倾覆了基因测序运用的观点。MinION被称为口袋测序仪，只要4英寸长，约莫平凡U盘巨细，由一个传感器芯片，公用集成电路以及一个完备的单份子感到测试所需的流控体系组成。比拟以前足足冰箱巨细的仪器，玲珑利便的MinION具备越发广泛的运用场景。更有媒体以为，MinION将倾覆基因测序，可用在病原病毒的倏地鉴定，埃玻拉病毒监测，情况监测，食物保险监测、抗生素抗性监测，阐发癌症布局异变，单倍体基因型、胎儿DNA阐发和其他运用步伐。

MinION接纳新型纳米孔测序法（nanopore sequencing），平均每一个纳米孔每一秒可浏览90个核苷酸。但MinION的过错率也让不少人感应鸡肋，2014年初期实验阶段偏差率于30%摆布。Oxford Nanopore也深知MinION的瑕疵，不停对于产物进级换代，节制其过错率。到了2016年最新版本的R9已经经将各种型DNA测序过错率降低到了2-13%.2016年10月正式发布的R9.4再次对于产物总体机能做了进一步晋升。

2015年5月，第一次纳米孔传感集会召开，MinION技能用户以及MAP规划介入者齐聚一堂彼此交流会商。也恰是于这个时辰，MinION最先走向贸易化，MAP逐渐蜕变成纳米孔社区交流会。12月，MinION用户第一次纳米社区交流会揭幕。

PromethION

PromethION平板测序仪

2016年10月的美国人类遗传学年夜会上，公司初次宣布了PromethION测序仪。而实在早前Oxford Nanopore就仿照MinION发布模式，在2015年7月启动PromethION 拜候规划（PromethION Access Progra妹妹e PAP）。

PromethION是一款平板式测序仪器，比iPad年夜一些，内含144000个纳米通道，可举行多个自力样本的测序。这款仪器维持了MinION的简朴易用、软件直不雅以及少少样品制备的特色，可以或许带来低成本、可扩大且长读取的测序，利便对于流程矫捷性有着更好要求的用户。

Oxford Nanopore还提出了一个 Run until 的观点。PromethION装备让用户能运转试验，直到得到充足量的数据，或者有充足高品质的数据到达预设的试验尽头。比拟之下，其他阐发体系都有着固定的阐发时间，于运转竣事时带来一批固定的数据。于这类环境下，用户不能不设计试验，以满意仪器的机能。

相反，经由过程哄骗纳米孔传感的性子以及倏地电子测定，用户可以或许唆使PromethION，以监控其自身的数据输出，并寻觅运用特异的成果。哄骗这些成果，用户可以及时地转变或者优化仪器的举动，或者于获悉试验完成后住手仪器。

Voltrax

主动化样品制备体系Voltrax

除了了便携观点的测序仪器，Oxford Nanopore还于追求其他环节的测序新体验。

2016年5月16日London Calling集会上，公司发布了一系列新产物。此中，最受存眷确当属首席技能官Clive Brown的陈诉。预会者称是一次 转变游戏法则的 发布会，形容其时的氛围就像2007年苹果发布iPhone同样。

Clive Brown称，他们的方针是将样品制备时间缩短到10分钟。为了实现这一点，Oxford推出了主动化样品制备体系Voltrax.新产物一样延续了以前产物便携带的特色，并且是可编程的，有6-12个样品输进口。只管这是一次性产物，但预会者照旧以为，及时测序时代真的来了。

据相识，Voltrax能将原始的生物样品转化建立便可测序的情势，且无需人工干涉干与。它可以或许与MinION或者PromethION测序仪间接对于接。2016年10月，Voltrax导航规划（VolTRAX Introduction Progra妹妹e）规划公布最先注册。

SmidgION

SmidgION手机测序观点产物

一样是此次London Calling集会上，Oxford Nanopore还公布了SmidgION规划。SmidgION是牛津纳米孔全新的观点产物，哄骗跟MinION不异的技能，更年夜的亮点是可与手机兼容。今朝产物尚于开发中，假如患上以实现，基因测序或者可能步入手机测序时代。

与罗氏以及Illumina两家比拟，Oxford Nanopore显患上越发年青态。不单单是测序产物的出产，更多的是观点上新的冲破。公司所有产物于纳米孔测序的技能上，连结便携特色，终极但愿实实际时测序，极年夜的扩宽了基因测序运用场景。

发展的懊恼，与IIllumina多年讼事战

但Oxford Nanopore的成长也并不是一路顺风，最使公司头疼的应该就是与Illumina纠缠多年的讼事。

2016年2月，IIllumina同时向美国国际商业委员会以及美国南加�ֲ�APP州处所法院提出诉讼，告状Oxford Nanopore加害其美国专利局第8673550号以及9170230号专利，这两个专利的所有权授予相干公司与机构运用与转化MSP纳米孔及相干技能。作为这两项专利的所有者，Illumina公司仅独家授权阿拉巴马年夜学、伯明翰研究基金会和华盛顿年夜学使用该技能。，Illumina暗示这项诉讼将重要针对于Oxford Nanopore的MinIon与PromethIon体系。

这也并不是两家公司于法庭上的第一次交手。早于2009年互助时期，两家公司睁开了一场关在Oxford Nanopore核酸外切酶纳米孔测序计谋贸易化的诉讼。Oxford Nanopore作为败诉者抛却了于其MinIon与PromethIon体系中运用核酸外切酶纳米孔测序计谋，同时也使患上两家公司中断了他们的贸易和谈。

2016年8月， 美国国际商业委员会近日发布文件称，Illumina公司以及英国Oxford Nanopore的讼事已经经庭外息争。纳米孔公司赞成再也不出口或者售卖包罗氨基酸序列纳米孔的产物，并销毁今朝库存的产物。这一场纳米孔专利之争终极照旧落下帷幕。

不外，该文件也明确暗示，这些限定不会影响牛津纳米孔对于CsgG的使用。

纵向范畴摸索，MinIon真的上了天

即便贫苦不停，牛津纳米孔也从未住手技能上的摸索。于横向产物线逐渐富厚以后，牛津纳米孔最先追求纵向范畴的摸索。

Oxford Nanopore始终致力在成立 互联网生物 的观点，这个设法发源在加州圣塔克鲁的一个生物信息学试验室的 互联网DNA 观点。2015年，Oxford Nanopore CTO Clive Brown于Wired的一篇文章中指出： 将来，牛津的传感装备将与云阐发平台毗连，可挣脱有线装备以及时间地区的局限。

互联网生物的憧憬可参考2015年Yaniv Erlich的一篇论文，文章假想了一个基因组学无处不于的将来。Erlich于文中提到： 与测序传感器的集成可倾覆今朝的许多装备，包孕空调或者者水质监测体系。 对于在与康健有关的运用，他指出： 倏地测序可以用在机场的感染性疾病病原体监测，而且可认为已经经遭到传染的搭客提供医疗赞助。一样的一个便携式的音序器可以或许为大夫提供更切确的诊断辅助。尤为对于在人性主义危机场合，省去了将样品送到试验室的环节，节约了年夜量的时间。

2016年7月，一台MiniON测序仪搭乘SpaceX 9号进入到国际空间站。此次Oxford Nanopore的技能真正上了天。

这次使命重要是为验证MiniON于微重力下的机能，而且为下一步摸索做好预备。有人提议NASA可经由过程于太空中举行DNA测序来检测微生物于情况中的变迁，或者者人类于太空航行中的各项身体性能反映，以至检测到宇宙中其他DNA生物。

此次航行使命中，国际空间站的宇航员乐成哄骗MiniON测序仪于太空中完成为了细菌、噬菌体和啮齿目植物等从地球上带去的样本的测序使命。研究职员于地球上对于MiniON于差别情况下的事情状况举行评估。此外，这台MiniON测序仪还将作为研究装备继承保留于国际空间站内，将来有可能为更多的科学研究提供撑持。

Illumina于基因测序仪全世界市场的统治职位地方无可厚非。对于在Illumina而言，赛默飞，承平洋生物以及QIAGEN都只是触摸到基因组学市场的边沿，其实不足以对于本身组成威逼。而只管正确性始终是Oxford Nanopore挥之不去的问题，但跟着研究深切，这都是极有可能解决的问题，对于Illumina而言是越发间接的威逼。

Oxford Nanopore也深知Illumina是一家能打硬仗的公司，仅仅是测序技能上的冲破其实不必然能帮忙他们于Illumina的强势统治下据有市场份额。追求观点上的冲破，不停摸索及时测序的门路，这也恰是牛津纳米孔的智慧的地方吧。

这次的投资方包孕GT医疗，中国泛亚洲基金、IP集团和现有投资方Woodford投资。CEO Gordon Sanghera暗示，本次资金将用在商务营业规模的拓展，包孕亚洲地域（尤为是中国地域）。

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